引用伊藤は大臣を集め、参政大臣（首相）韓圭咼（※）の保護協約反対の訴えを聞いたあと、 一人一人の閣僚から意見を求めた。 まず外部大臣朴斉純がだんぜん不同意だが皇帝の命令とあればいたしかたないと述べると、 伊藤はそれでは命令なら調印するのだから不同意ではないと分類してしまった。 このほか度支部大臣（蔵相）閔泳綺が絶対反対を述べたが、学部大臣李完用は、逆に日韓両国は実力が違うのだから、 「未ダ感情ノ衝突セザル、未ダ時機ノ切迫セザル今日ニ於テ円満ニ妥協ヲ遂ゲ」ることが望ましいと積極的に賛成の態度を明らかにした。 残る四大臣も李完用に同調した。

これを聞いた伊藤は、これでは閣議は多数決で協約に賛成ではないか、それなのに調印の手続きをとらないのは日本と絶交するつもりか、 と韓参政につめよった。 進退きわまった韓が号泣しながら別室にしりぞくと、伊藤は閣僚の希望をいれて二、三の修正を行ない、 宮内府大臣に裁可を求めるよう要求した。 皇帝は韓国が独立を維持する力を蓄えたときにはこの協約を撤回するような規定がほしいと希望、 伊藤はこれをいれて「韓国ノ富強ノ実ヲ認ムル時ニ至ル迄」との一句を加え、 その場で浄書し、林公使と朴外部大臣が署名調印した。 時に夜中の十一時であり、伊藤らが退出したのは午前零時をすぎていた。

韓国植民地化の決定的な曲り角がすぎた。 協約は、日本が東京の外務省により、韓国の外国に対する関係および事務を監理・指導すること、 日本政府の代表として統監一名を置くことなどを規定した。