引用国民の圧倒的支持を受け、自信に満ちたマッキンレーは、二期目に対して意欲的な抱負を持っていた。 前例にないキューバ、プエルトリコへの視察、トラスト問題への取り組み、高くなりすぎた関税問題の検討等である。 一九〇一年三月四日に就任、各地へ遊説旅行に出かけ、国民の義務、国家の目標、繁栄、アメリカの輝かしい未来について、 熱狂的な群衆に語り掛けた。 日頃から国民と親しく接することを誇りとしていたが、結局これが命取りとなってしまった。 ニューヨーク州バッファローで開催された汎アメリカ博覧会の開会式（九月六日）に出席後、 二人の護衛官に守られ公式のレセプションを催したが、歓迎の列に加わっていた無政府主義者のピストルで至近距離から撃たれ、 九月十四日息をひきとった。